АО «НПЗ Брод» работает в соответствии с экологической лицензией, выданной Министерством территориального планирования, строительства и экологии при Правительстве Республики Сербской. Проводимые компанией АО «НПЗ Брод» меры в сфере экологии изложены в экологической лицензии, и соответствуют экологическим стандартам. 

АО «НПЗ Брод» выполняет обязательства в области охраны окружающей среды, в соответствии с правовыми рамками, проводит меры по снижению отрицательного воздействия на окружающую среду, осуществляет мониторинг во время работы завода, а также во время остановок технологических установок в случае их капитального ремонта.

Экологической лицензией определяются меры по предотвращению выбросов в атмосферу, в почву и воду, по сокращению отходов и другие меры на этапе эксплуатации установок, а также предельные значения отдельных контролируемых параметров.

В соответствии с экологической лицензий осуществляется регулярный внешний мониторинг уполномоченными и сертифицированными учреждениями.